Tryb działania naczelnika urzędu skarbowego określają następujące akty prawne:
- ustawa z dnia 16 listopada 2016 r. o Krajowej Administracji Skarbowej;
- ustawa z dnia 16 listopada 2016 r. Ustawa z dnia 16 listopada 2016 r. Przepisy wprowadzające ustawę o Krajowej Administracji Skarbowej;
- ustawa z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa;
- ustawa z dnia 13 października 1995 r. o zasadach ewidencji i identyfikacji podatników i płatników;
- ustawa z dnia 14 czerwca 1960 r. Kodeks postępowania administracyjnego;
- ustawa z dnia 5 sierpnia 2010 r. o ochronie informacji niejawnych;
- ustawa z dnia 17 lutego 2005 r. o informatyzacji działalności podmiotów realizujących zadania publiczne;
- ustawa z dnia z dnia 10 września 1999 r. Kodeks karny skarbowy;
- ustawa z dnia 6 czerwca 1997 r. Kodeks postępowania karnego.